隋军在疏勒国中的大清洗引起疏勒政坛很大的震荡，但实际上并不影响底层百姓的生活。
秦琼很清楚，对待这些番人，要“打一棒给个甜枣”，于是在清洗之后，先是减免疏勒国中百姓一年的赋税，又废除了阿弥厥当政其间的苛政、暴政，并处置了一批基层民怨极大的贪官污吏。老百姓可不管当权的是谁，就看谁给你带来好处，于是隋军很快便得到疏勒国百姓的拥戴。
到了这个时候，大隋根本不需要扶植代理人，而是直接赤膊上阵。
大清洗没涉及到阿弥厥，但整个疏勒王室也被清洗个七七八八。
秦琼以帮助阿弥厥学习大隋文化为由，将阿弥厥一家送往轮台，包括其他一些不适合清除但也不适合留在疏勒的人员，全部送往轮台。与其他几个送到轮台的国王一样，以后他们再也回不到疏勒了。
阿弥厥此时是砧板上的鱼肉，任人宰割。而且阿弥厥也不是什么有气节的君主，再是无奈忿恨，但为了保住小命，只得听之任之。
处置完疏勒王室，隋军在在其地堂而皇之地设置官府。黄明辽从都护府下令，将疏勒国分置达满、演渡、遍城三县，并置疏勒军镇，以秦琼兼任镇戍使，置兵八千人。
西域三镇安抚招讨司随之改为西域四镇安抚招讨司。
疏勒军镇西北从北疏勒山口通往热海，西面则是葱岭阻隔河中和吐火罗，西南则可通过大小罽宾（迦湿弥罗）进入天竺诸国，东南则可直达女国，可谓是西域的要道。
整个西域的贸易，都要从这里经过。
大隋控制了这里，西可进入河中，威胁西突厥腹地；西南可连接吐火罗，绕开西突厥，直接与波斯等国联系；南可进入天竺，开拓南亚次大陆；东南可进入羌塘之地，威胁未来将要崛起的吐蕃。
最最重要的是，大隋在天山以南的防线，最关键的西面一环，彻底闭环了。
秦琼占领疏勒之后，身边便还剩两个小国，一个是朱俱波，另一个则是喝盘陀。
朱俱波在疏勒的东南方向五百里，亦名朱居盘国，汉代时叫子合国，乃西域古国。现在的朱俱波是北凉诅渠家族之后所建，王为疏勒人，都叶城（今新疆叶城县），算是疏勒、于阗的一个共同属国。不过朱俱波国势不弱，有兵上千人，而且其国受西突厥影响很大，国内上下皆是亲西突厥派掌权。
大隋占领疏勒之后，晓谕四方。朱俱波却因为政治倾向，故意不与大隋接触。
秦琼乃派使节前往朱俱波，令其投降。
大隋连疏勒、龟兹这种大国都半灭亡了，自是不会留朱俱波这种小国存在，而且还是个不知死的小国。
为了能彻底占领此地，秦琼故意命使节刘焕之装作狂悖无礼的样子，激怒对方。刘焕之到了朱俱波，当场发难，狠狠地羞辱了朱俱波国王一番，还要朱俱波国内速速投降，否则必尽诛之。
朱俱波国王果然被激怒，拒不投降，还命人将隋使驱逐。倒不是朱俱波讲礼仪，不斩来使，而是刘焕之身边带了五百骑兵，朱俱波人根本就不敢轻举妄动。
秦琼得信之后，心中大喜。
他早就命大将贺润率隋军一千，疏勒兵两千在朱俱波国境外准备，就是为了等一个出兵的机会。现在朱俱波给了大隋这个机会。
朱俱波担心隋军出兵，便紧急动员国内百姓。但他们没有料到，隋军来的如此之迅速。朱俱波本就是一个小国，面积狭小，人口不多，也没有什么纵深。
所以隋军急进，一路直袭朱俱波国都之下。
三千人马，或许并不多。但一夜之间，突然出现在城下，对于城中上下的震撼是无法言表的。就连原本似乎态度强硬、意志坚定的朱俱波国王此时也慌了神。
整个朱俱波国上下，更是乱作一团。
贺润头天到达城下，第二日便率军发起了攻击。隋军一鼓作气，猛攻朱俱波城。
弓弩是守城利器，同样是攻城利器。
隋军用密不透风的强弓劲弩压得朱俱波军在城头上抬不起头。而附从的疏勒军则趁机蚁附攻城。
贺润不惧伤亡，昼夜不息地攻打城池。到了第二日下午，终于为隋军攻上城墙，杀入城中。
朱俱波国王带着一众亲信退入内城。
贺润眼看对方据守，又下令士兵集中城中的柴火，全部堆积到内城城墙之下，然后让人点起火来。
大火弥漫，沿着城墙烧了起来。隋军又在外以弓弩戒备，敢有探出头来救火的，尽被弓弩射死。
于是内城之中的守军，是焦头烂额，惶惶不可终日。
最后朱俱波国王实在撑不住了，只得派人出城投降，朱俱波遂下。
朱俱波本是小国，无论是实力还是影响力皆是有限。大隋直接以抗拒王师为由，废除了国王，又在其地置碛南县，归属疏勒军镇管辖。
至于朱俱波国中，敢于抵抗的都死在了隋军攻城之中，往后这里便是大隋的顺民之地。
隋军占领了朱俱波，把目光又放在了葱岭的喝盘陀。
葱岭之地，是西域之中隆起的一片高地，沟通西域四面八方。既是屏障，也是阻碍。所以在葱岭之上的喝盘陀变成了要害之地。
喝盘陀（今新疆塔什库尔干塔吉克自治县一带）也是一个西域小国，有城十二，其在汉时国名蒲犁。居民从事农牧业，有文字，信佛教，人劲悍，王自称“汉日天种”，常坐金床理事。喝盘陀有胜兵千人，国王也是疏勒人。
无论是朱俱波还是喝盘陀，虽离疏勒更近，但外貌、语言皆与于阗相同，同时又受天竺影响深重。
疏勒既下，而喝盘陀还为突厥人所控制。突厥人也明白此地的重要性，专门在此置兵以守卫。
秦琼占领疏勒之后，便命人传信喝盘陀投降。当然这次是真正的劝降，毕竟喝盘陀和朱俱波情况不同。但喝盘陀人不仅不降，大隋前往喝盘陀的使节也直接被突厥人所杀。
秦琼听闻之后，勃然大怒，乃亲率两千汉兵和三千疏勒兵西征喝盘陀。