自从5年前这个位面的历史和宇宙被岸本重新改写，大筒木在这方宇宙内诞生，曾经的历史已被改变，变成了新的塑造，不管合不合理，整个位面所有的生命包括亡灵都被岸本植入记忆和法则，这个位面的一切也在融合。
这个位面有着无数宇宙，忍界就存在其中一方宇宙中，而宇宙之外则有更加强大的存在。100亿年前，这片宇宙中发生了大爆炸，混沌中的物质四散大爆炸，空间不断膨胀，形成了各大星系，若干年后，诞生了第一批生命，大筒木一族。他们天生就有着强大的力量，悠长的生命，还有独家能力“楔”可以转生。
慈玄本是忍界一个普通死亡后的和尚，岸本改写位面规则后他成为了大筒木一式拥有了新的记忆和一切。他来自外星的大筒木一族，大筒木有着无数的家族，而在忍界所在的星系离的最近的一个小家族族长叫大筒木矢楳，副族长大筒木芝居，慈玄就来自矢楳家族里的一名分家成员。
矢楳通过不断吞噬查克拉果实最终成为前往大筒木家族里更高纬度的地方，类似于出了新手村跑别处练级，因为凡俗之躯无法接受更高的灵气，于是留下躯壳离开。因为族长的出走，随后副族长大筒木芝居接管了家族，整个小家族的成员纷纷往外开拓，很快芝居也离开了。这个小家族在大筒木的分量就类似于春野家族在木叶的分量，总之很小，不过在矢楳和芝居相继突破新手村后分量相对大点。
随着开拓中，家族里的园丁一式带着副手园丁辉夜来到忍界种树，结果辉夜在果实即将成熟时偷袭将他喂给神树，好在一名叫慈玄的人类路过得以活了下来。
一式以慈玄这个人类姿态潜伏于忍界之中，在漫长的时间里他不动声色地审视着每一个可能成为他目标的人。千年的时光对他而言不过是漫长的等待，他耐心地寻找着那个能够承载他力量的完美躯体。
当前的忍界，依旧被大筒木辉夜的后代——羽衣与羽村所遗留的阴影所笼罩。尽管这两已逝，但他们所施加的阴阳封印之力依旧在无形中维护着某种平衡，而月亮之上，封存着辉夜那化作十尾时的身躯。
一式深知，要突破这层层的限制获取神树，重获自由与力量，必须找到一个合适的容器。然而，这并非易事，他需要的是一个能够完美融合他大筒木血脉与力量的身体，而这样的身体在忍界中实属罕见。
因此，慈玄继续在暗中观察，耐心地等待着。他明白，每一次的出手都至关重要，因为一旦离开慈玄这个身躯，他的寿命便只剩下三次机会。所以哪怕他现在早已无敌忍界但行事却十分谨慎，只有在确保万无一失的情况下，他才会迈出一步，他要确保时机以最完美的姿态降临于世，种下神树收取这个星球的能量,实现他来到这个星球的夙愿。
大筒木一族，以其深邃的科技文明着称，甚至掌握了穿梭时空（平行宇宙）的尖端技术，然而，大筒木一式身为种植领域的专精园丁，对这些高科技知之甚少。随着忍界逐渐显露出科学的曙光，大筒木一式想种植神树回收查克拉果实但玄策的身体无法容纳他的能量导致自己无法现世。千年的游荡还没有找到完美的身躯，一式萌生了一个构想，亲手培育一个完美的转生容器，并为此构建一个秘密基地。
为了实现这一宏伟计划，一式悄然穿梭于忍界，不仅学习了宝贵的谦虚与低调，更精心策划，避免引起不必要的注意。他巧妙地构建了一个组织结构，将麾下力量划分为内阵与外阵：内阵由忠诚且能力出众的核心成员组成，他们是计划的基石；而外阵，则是由临时招募的精英构成，灵活应对各种任务需求。
在这一精心布局中，阿玛多成为了一式重点关注的对象，他展现出的卓越科学才能与独特见解，让一式看到了将其纳入内阵、成为核心团队一员的巨大潜力。同时，一式的战略布局也悄然影响着忍界的某些角落。
如雪之国，四年前的一场政变如同冬日里的惊雷，震动了整个国家的根基。风花怒涛的叛乱不仅终结了风花早雪的和平统治，更让这片土地陷入了前所未有的动荡与混乱。风花早雪麾下有一名年轻的科学家叫博罗，喜欢身穿黑色斗篷、身材魁梧的年轻男子，脸上曾被忍者残忍地刻下了罗马数字“3”的烙印，却掩盖不住他眼中闪烁的对科学的狂热，他在科学技术领域有着非凡天赋。
一次偶然的机会，玄慈因世界线变得的意外在游荡时来到了雪之国，并在那里提前邂逅了博罗。博罗所展现着的对科技未来的独到见解，深深吸引了一式的注意。他意识到，博罗正是他寻找已久的科技人才。于是，一式亲自邀请博罗加入内阵，一式将属于大筒木一族的科技蓝图展示出来，毕竟没吃过狗肉也见过狗跑一阵神术弱化版的幻术将一式见过的那些令人惊叹的一些大筒木科技将科技构想呈现给博罗。并给予他前所未有的支持与资源，让他进行科技的研究。
博罗看着前所未有的科技蓝图，研究速度迅速，雪之国迎来了一场科技革命，在玄慈的支持与协助下，博罗不仅在内阵中迅速站稳脚跟，还凭借其先进的科技理念，在雪之国建立了一座秘密基地。这座基地成立后科技研发进度加快，玄慈找来不少来自世界各地的顶尖科学家与工程师，而博罗等人也加快了科技研发速度，创造出了一系列令人瞩目的科技成果。雪之国这个原本边缘化的小国迅速崛起为科学发展的前沿阵地，目前出现火车，飞艇都是为了运输物资研究，查克拉铠甲则是为来科学忍具的先驱。
巴古，这位在汤之国原本默默无闻、身材矮小且性格内向的中年人，命运的捉弄让他意外地卷入了一场风波之中。容器的生物研究需要人体实验，汤之国有“忘却战争的国家”之称，这样的环境被玄慈看重，玄慈在汤之国建立了一个“邪神教”，随着博罗的生物实验展开，玄慈深知要维持一个“邪神教”的运作，不仅需要极端的信仰和教义，还需要一个忠诚且高效的管理者来确保组织的日常运作不受干扰。于是，他选择了巴古，将管理和维护这个邪教基地的重任托付给了他，为博罗的研究提供人体的各种器官做实验，玄慈就将年轻的博罗任命为外阵成员巴古的上级。
起初，巴古对这一切感到震惊和迷茫，他从未想过自己会与邪教扯上关系，但玄慈的手段让他不得不屈服。随着时间的推移，巴古逐渐沉浸在了“邪神教”所营造的虚幻世界中，他开始相信那些荒谬的教义，并全心全意地投入到基地的管理工作中。在巴古的精心策划下，这个邪教组织逐渐壮大，吸引了越来越多的信徒加入。他们被洗脑、被操控。
与此同时，汤忍者村虽然因战争的远去而失去了昔日的辉煌，但其丰富的自然资源仍吸引着那些对力量与战斗充满渴望的灵魂。飞段，一位性格极端、渴望战斗的忍者，对汤忍者村的和平主义深感不满，他的目光逐渐被新兴宗教“邪神教”所吸引——一个以杀戮为信仰，以疯狂为教义的极端组织。飞段的到来，为邪神教注入了新的血液，也预示着更加疯狂与血腥的实验即将展开。
玄慈敏锐地捕捉到了飞段对战斗的无限渴望与对鲜血的狂热，这让他看到了一个前所未有的实验契机。借助博罗在生物领域取得的突破性研究成果，玄慈精心策划了一场针对飞段的极端改造实验。他手中的关键，是从大筒木芝居飞升之后留下的神秘躯体上切取下来的部分细胞，这些细胞蕴含着未知而强大的力量。
邪神教的实验室内，有一种阴森恐怖的氛围。飞段静静地躺在冰冷的仪式上，身体已被深度麻醉，意识沉浸在无尽的黑暗之中。四周，科研人员紧张而有序地忙碌着，随着玄慈的命令，实验正式开始。那些珍贵的细胞被小心翼翼地注入飞段的身体，就像一股暗流悄然涌入平静的湖泊，瞬间激起了层层波澜。细胞与飞段的血肉开始融合，一种古老而强大的力量在他体内悄然觉醒，仿佛沉睡的邪神被唤醒，准备吞噬一切。
当飞段再次睁开眼睛时，他的眼神已经发生了翻天覆地的变化。那是一种混合了疯狂与狂喜的光芒，他尝试着挥动拳头，感受到了身体的变化，即便是最致命的伤害也无法让他倒下。飞段意识到，自己已经被赋予了不死之身。这份力量让他感到兴奋，他开始疯狂地攻击周围的一切，试图理解并掌控这份突如其来的力量。实验室内顿时陷入了一片混乱与血腥，飞段的笑声与尖叫声交织在一起，充满了绝望与疯狂。
然而，对于玄慈而言，飞段的实验的失败了，击碎了他原本完美的计划。他发现飞段的身体只拥有大筒木的部分特征不死特性，除此之外未有其他任何强化。玄慈望着飞段那疯狂的身影，眼中闪过一丝复杂的遗憾情绪。他放弃了这处基地，与巴古悄然离开，留下了一个被疯狂与绝望笼罩的实验室，以及一个失败的实验品飞段。
谷之国，维克多正值中年，虽身形矮小却目光如炬，他那标志性的黑色斗篷下隐藏着对科技无尽的渴望与执着。在一次谷之国的秘密交易会上，维克多正以其独特的身份游走于各路商贾与忍者之间，他渴望力量和权力，在忍者的争夺中他的右眼被刺伤戴着眼罩，腿因为被起爆符炸断而装上假肢。玄慈在游荡时查看到维克多在商业上的才能，组织的运转需要大量资金而选中了他。
风暴中，维克多正艰难地保护着一份珍贵的医疗器械，不让其被雨水浸湿。玄慈以一道迅疾的身影出现在他面前，轻描淡写地为他挡下了肆虐的风雨，两人的目光在那一刻交汇。维克多从对方的身上看到了强大的力量。
“你的才能让我看重，加入我的组织吧，我将给予你权力和强大的力量！”玄慈的声音低沉而富有磁性，邀请维克多加入自己草创组织。
维克多心中一震，他被玄慈展现的力量吓住，而这样的强者给的机会也意味着他将踏上一条充满未知与危险的道路。然而，对力量的狂热追求让他无法拒绝这份邀请，他渴望在更大的舞台上实现自己的梦想。
“我愿意为你效劳。”
之后，维克多以其敏锐的商业嗅觉和深厚的行业资源，为壳组织注入了最初的运营活力。通过研发出的附属产品，将目标锁定在医疗器械领域，这一领域不仅利润丰厚，且与组织方向高度契合。这些产品在周边国家迅速占据了一席之地，还成功打入其他国家市场，为组织带来了源源不断的资金流，壳组织正式运转。