初代道侣的虚影消散后，逆命之树的命核发出不稳定的脉动，暗紫色的能量如蛛网般在树身蔓延。林婉与秦逸的医疗舰在剧烈的能量波动中剧烈摇晃，仪表盘上的警报声此起彼伏，显示命核随时可能再次爆发熵化。星孩融合后的身影悬浮在虚空中，归墟能量在他周身流转，却无法完全压制命核的躁动。
“锈蚀银针的替代品...究竟是什么？”林婉握紧残破的典籍，失明的双眼中闪烁着焦急的光芒。她的意识体与典籍深度共鸣，试图从古籍中寻找线索，然而书页间只残留着初代道侣模糊的呓语：“因果循环，始于终焉...”秦逸的银纹在操作台上急速游走，观测者之力疯狂扫描整个星域，试图找到能替代银针的能量源。
就在众人陷入绝望之际，星孩突然开口，声音中带着归墟能量特有的震颤：“我感受到了...初代道侣留下的最后后手，在时间的尽头。”他伸手撕开空间裂缝，露出一片混沌的领域，那里漂浮着无数破碎的时间碎片，每一片都映照着不同的可能性。“但进入那里，我们可能永远无法回来。”星孩的警告让空气瞬间凝固。
“没有选择。”林婉毅然站起身，将典籍化作金色战甲披在身上，“为了宇宙的存续，哪怕是时间的尽头，我们也要去！”秦逸没有犹豫，银纹化作锁链缠绕在两人身上，观测者之力强行稳定空间通道。医疗舰队的船员们自发启动舰船的所有能量，为他们开辟道路。当三人踏入时间裂缝的刹那，现实宇宙的时间仿佛静止，逆命之树的命核进入最后的倒计时。
时间尽头的混沌领域中，漂浮的时间碎片如同锋利的刀刃。林婉的战甲刚接触碎片，便出现道道裂痕；秦逸的银纹被碎片切割，发出刺耳的嗡鸣。星孩驱动归墟能量，形成保护罩，却发现能量在这片领域中消散得极快。“小心！这些碎片里藏着初代道侣最痛苦的记忆！”星孩的提醒声未落，一块碎片突然迸发出强烈的光芒，将三人吸入其中。
林婉发现自己置身于初代道侣的实验室，年轻的道侣正疯狂地进行着熵寂实验。她试图与道侣对话，却如同虚影般无法触碰。而在另一片碎片中，秦逸目睹了道侣将希望与绝望注入星孩的全过程，那些复杂的能量公式和绝望的泪水，让他的银纹都为之颤抖。星孩则被困在一片漆黑的碎片中，无数声音在他脑海中回荡，善与恶的记忆不断冲击着他的意识。
“原来...锈蚀银针本就是时间尽头的产物。”林婉在记忆碎片中顿悟，“它不是用来消灭熵寂，而是用来封印因果循环！”她驱动典籍，将金芒注入周围的碎片，试图拼凑出银针的形态。秦逸则用银纹解析碎片中的能量结构，观测者之力在混沌中寻找着关键节点。星孩拼尽全力稳定自身意识，将归墟能量化作粘合剂，协助两人。
在三人的努力下，一根由时间碎片凝成的“因果银针”逐渐成型。银针表面流转着过去与未来的光芒，每一道纹路都刻着宇宙的生灭。但就在他们准备离开时，逆医文明的残余势力突然从裂缝中杀出。为首的指挥官手持熵能巨斧，狞笑着说：“你们以为能阻止熵寂？因果的闭环，由我来斩断！”
激烈的战斗在时间碎片中展开。林婉的典籍化作千手观音，每只手掌都结出不同的时间印诀；秦逸的银纹如闪电般穿梭，观测者之力扭曲着敌人的攻击轨迹；星孩则将归墟能量与因果银针结合，释放出能回溯时间的“逆溯之光”。然而，逆医舰队的数量太多，他们的攻击不断消耗着银针的能量。
“必须有人留下来拖延时间！”秦逸的银纹出现崩解迹象，他毅然决定牺牲自己，“我用观测者之力封锁这片领域，你们带着银针回去！”林婉想要阻止，却被秦逸的银纹强行推出碎片。在最后的瞬间，她看到秦逸的身影在熵能的冲击下逐渐透明，他的嘴角却带着释然的微笑。
林婉与星孩带着因果银针回到现实宇宙，逆命之树的命核已经膨胀到极限。千钧一发之际，林婉将银针插入命核，金芒、归墟能量与时间之力交融，形成强大的封印。逆命之树的暴动终于平息，树身的暗紫色逐渐褪去，重新焕发出翠绿的生机。
一切尘埃落定后，林婉站在逆命之树下，手中握着秦逸残留的银纹碎片。星孩将归墟能量注入宇宙，修复着被破坏的星系。而在时间的尽头，秦逸的意识并没有消散，他成为了观测时间长河的守望者。初代道侣的声音在虚空中响起：“因果闭环，终得圆满。但熵寂的威胁，永远不会真正消失......”
宇宙恢复了暂时的平静，但林婉知道，新的危机随时可能降临。她握紧手中的典籍，与星孩相视点头。作为医者，他们将永远守护这片宇宙，哪怕前方是无尽的挑战。而在宇宙的某个角落，熵寂的阴影仍在蠢蠢欲动，等待着下一次破局的机会......