墟渊之战的余波尚未完全平息，宇宙各处便接连出现诡异现象。遥远星系的星轨开始无序偏移，古老文明的遗迹中传出未知频率的震颤，而砚儿手中的“骸寂之匙”更是持续散发着刺目的红光，匙身新生成的纹路如同活物般不断扭曲变化。
“这些异常绝非偶然。”云汐的指尖划过星图残留的碎片，重组后的星图表面笼罩着一层淡淡的黑雾，“熵暗虽已消散，但他引发的混沌波动在宇宙深处形成了无数不稳定节点，就像随时可能爆发的定时炸弹。”她调出近期收集的宇宙观测数据，投影中，数十个星系正以违背常理的速度坍缩，而在它们的中心，隐隐有暗紫色光芒闪烁。
楚瑶握紧断剑，剑身的裂痕中渗出丝丝缕缕的混沌气息。自从熵暗之战后，这把承载着上古记忆的武器便时常不受控制地震颤，仿佛在感知着某种威胁。“我能感觉到，有股力量正在暗中收集熵暗残留的混沌碎片。”她的目光投向虚空深处，那里，几片暗紫色的荆棘残片正顺着时空裂缝悄然游走。
三人决定分头行动。云汐驾驶着经过改造的星舰，前往受影响最严重的“熵蚀星域”，试图利用星舰上的“骸寂共鸣器”定位混沌波动源头；楚瑶则循着断剑的指引，深入古老文明的遗迹，探寻那些神秘震颤背后的真相；而砚儿留守墟渊，研究“骸寂之匙”的异常变化，并修复被严重破坏的墟渊封印。
在熵蚀星域，云汐的星舰刚一进入，所有仪器便发出刺耳的警报。透过舷窗，她看到本该璀璨的星辰此刻黯淡无光，表面布满暗紫色的纹路，宛如被腐蚀的金属。“骸寂共鸣器”突然剧烈震动，屏幕上的波纹显示，在星域核心处，存在着一个不断吞噬能量的“混沌漩涡”。
当云汐小心翼翼地靠近漩涡时，星舰的防护罩瞬间被撕开一道裂口。暗紫色的雾气涌入舱内，凝结成一张张扭曲的面孔，正是曾经被熵暗操控的堕落神明虚影。“你们以为能阻止混沌的脚步？”虚影发出阴冷的笑声，“真正的黑暗，才刚刚开始。”云汐迅速启动应急装置，将星舰的能源核心与“骸寂共鸣器”强行连接，爆发出的能量将虚影驱散，但也导致星舰失去动力，开始向漩涡中心坠落。
与此同时，楚瑶在遗迹深处发现了一座布满荆棘纹路的祭坛。祭坛中央，摆放着一块散发着幽光的水晶，水晶内部，封印着一枚跳动的混沌心脏碎片。当她试图用断剑净化碎片时，祭坛突然亮起，无数暗紫色藤蔓破土而出，将她死死缠住。藤蔓上浮现出初代议长的面容：“文圣传承者，你们以为打败熵暗就能高枕无忧？混沌的意志，早已渗透进宇宙的每一个角落。”
留守墟渊的砚儿也遭遇了意外。“骸寂之匙”突然自主飞向墟渊深处，匙身的红光将周围映照得如同炼狱。他紧追不舍，却发现匙指引向的，竟是一处从未被记载过的神秘空间。空间内漂浮着无数暗紫色的卵状物体，每个物体内部，都蜷缩着一个似人非人的身影，他们的身上缠绕着与熵暗同源的混沌气息。
“这些是...混沌的胚胎？”砚儿倒吸一口凉气，“骸寂之匙”此时发出尖锐的鸣叫，匙身纹路与胚胎表面的符文产生共鸣，空间开始剧烈震动。他意识到，有人正在利用熵暗残留的力量，批量培育新的混沌生物。
就在这时，砚儿的传讯器响起云汐和楚瑶焦急的声音。三人几乎同时发现，他们遭遇的危机背后，似乎都指向同一个神秘组织——这个组织继承了荆棘议会的衣钵，正在暗中策划一场更大的阴谋。而他们的最终目标，很可能是利用混沌胚胎，创造出一个新的、完全受他们控制的“熵暗”。
“我们必须尽快汇合！”砚儿握紧“骸寂之匙”，“但在此之前，我要先搞清楚，这些混沌胚胎究竟是从何而来。”他深吸一口气，将文骨之力注入匙中，准备直面即将苏醒的混沌威胁。而在宇宙的另一端，云汐和楚瑶也在各自的战场上，与混沌势力展开殊死搏斗。一场比对抗熵暗更加凶险的危机，正在悄然逼近...