密室中，石棺的颤抖越来越剧烈，低沉的嗡嗡声在狭小的空间内回荡，仿佛是来自远古的警告。柯南等人紧张地盯着石棺，不知道里面即将出现什么。
“大家小心，保持警惕！”柯南低声说道，同时示意众人慢慢往后退，寻找有利的防御位置。就在这时，石棺的棺盖缓缓移动，发出一阵刺耳的摩擦声。随着棺盖的逐渐打开，一股奇异的光芒从石棺内散发出来，光芒中似乎有什么东西在涌动。
众人定睛一看，石棺内躺着的并非尸体，而是一个散发着柔和蓝光的水晶球。水晶球表面流动着神秘的纹路，与他们之前看到的各种符号相互呼应。柯南小心翼翼地走近石棺，试图更清楚地观察水晶球。就在他靠近的瞬间，水晶球突然光芒大盛，一道影像从水晶球中投射而出，出现在众人眼前。
影像中，出现了一位身着华丽巫女服饰的女子，正是传说中的青叶巫女。她的面容庄重而严肃，眼神中透露出一种超越时空的深邃。
“后世的人们，若你们能看到这段影像，说明与这古老的秘密有缘。我是青叶，曾守护着这个关乎世界命运的秘密。此水晶球名为‘命运之瞳’，蕴含着打开另一个神秘世界的力量，但这力量一旦被心怀不轨之人利用，必将给人间带来灭顶之灾。多年来，我虽将秘密隐藏，但仍担心它会重见天日。若你们发现了这个地方，务必要阻止那些企图利用‘命运之瞳’达成邪恶目的的人。”青叶巫女的声音空灵而悠远，仿佛从无尽的岁月中传来。
影像继续播放，画面切换到一场激烈的战斗场景。一群身着黑衣的人试图抢夺“命运之瞳”，与青叶巫女带领的村民们展开殊死搏斗。尽管青叶巫女和村民们拼死抵抗，但黑衣人的力量过于强大。
“这些黑衣人，难道就是黑衣组织的前身？”灰原哀惊讶地说道。
柯南眉头紧锁，仔细观察着影像中的细节。他发现，黑衣人的首领身上的服饰图案与赤井秀一身上的纹身极为相似，这更加证实了他们与黑衣组织之间的紧密联系。
影像的最后，青叶巫女将“命运之瞳”放入石棺，并施展强大的封印术将其封印。同时，她留下了最后的警告：“若封印被破，‘命运之瞳’重现世间，务必找到拥有纯净心灵和坚定意志之人，方能掌控这股力量，阻止灾难的发生。”
随着影像的消失，水晶球的光芒也渐渐黯淡下去。柯南等人从震撼中回过神来，意识到他们肩负的责任更加重大。
“看来黑衣组织一直在寻找这个‘命运之瞳’，他们的最终目的就是利用它的力量实现他们统治世界的疯狂计划。”柯南说道。
“可是，我们该怎么阻止他们呢？这个‘命运之瞳’看起来如此强大，而且我们还不知道黑衣组织是否已经发现了这里。”光彦担忧地说道。
就在众人商讨对策之时，突然听到地面上传来一阵嘈杂的声音，似乎有很多人在走动。柯南心中暗叫不好，示意大家噤声，然后悄悄沿着通道返回地面。
当他们小心翼翼地探出头时，发现神社周围已经被一群黑衣组织成员包围。为首的正是那个曾经在废弃工厂出现过的神秘白大褂男人。
“看来他们还是找到了这里。我们得想办法拖住他们，不能让他们得到‘命运之瞳’。”柯南低声说道。
“可是，他们人太多了，我们怎么打得过？”元太有些害怕地说道。
“我们不能硬拼，只能智取。”灰原哀冷静地说道，“我们可以利用神社周围的地形和陷阱，逐个击破他们。”
柯南迅速观察周围的环境，发现神社周围有一些古老的机关和暗道，或许可以利用这些来对付黑衣组织。
“好，我们兵分三路。我和灰原哀去吸引他们的注意力，小五郎叔叔和元太、光彦利用机关和暗道对他们进行偷袭。步美，你留在这里，一旦有机会，就去通知警方。”柯南迅速做出分工。
众人各自领命，准备展开行动。柯南和灰原哀故意弄出声响，吸引了黑衣组织成员的注意。
“哼，果然是你们这些小鬼。又来坏我们的好事。”白大褂男人看到柯南和灰原哀，冷笑道。
“你们这些邪恶之徒，休想得到‘命运之瞳’。”柯南毫不畏惧地回应道。
黑衣组织成员立刻朝着柯南和灰原哀冲了过来。柯南和灰原哀灵活地穿梭在神社的建筑之间，利用地形巧妙地躲避着敌人的攻击。与此同时，毛利小五郎带着元太和光彦，悄悄利用暗道接近敌人。他们看准时机，触发了神社周围的一些古老机关。
只听一阵轰鸣声，从地下突然弹出许多尖刺，一些黑衣组织成员躲避不及，被刺中受伤。趁敌人阵脚大乱之际，毛利小五郎等人从暗道中冲出，与敌人展开近身搏斗。
元太发挥出他的大力优势，一拳打倒一个黑衣组织成员。光彦则利用他的智慧，巧妙地利用周围的环境，用树枝和石头制造障碍，阻止敌人的行动。
然而，黑衣组织的成员训练有素，很快就从混乱中恢复过来，开始组织反击。他们分成几个小队，一部分继续追捕柯南和灰原哀，另一部分则对付毛利小五郎等人。
柯南和灰原哀在逃跑过程中，发现了一个隐藏的地下室入口。他们灵机一动，决定将敌人引入地下室，然后利用地下室的复杂地形将其困住。
“灰原，我们把他们引到地下室去。”柯南说道。
“好，我来引开他们的注意力。”灰原哀说着，拿出一个烟雾弹扔向敌人，然后朝着地下室入口跑去。黑衣组织成员看到灰原哀逃跑，立刻追了上去。
柯南则在地下室入口附近，设置了一些简易的陷阱。当黑衣组织成员进入地下室后，柯南迅速触发陷阱，一块巨大的石板落下，堵住了地下室的出口。
“可恶，让他们跑了。”地下室里传来黑衣组织成员愤怒的吼声。
与此同时，毛利小五郎等人与另一部分黑衣组织成员的战斗也进入了白热化阶段。毛利小五郎虽然身手不凡，但敌人人数众多，渐渐有些力不从心。元太和光彦也在战斗中受了一些轻伤。
就在局势对他们不利的时候，步美成功通知了警方。远处传来了警笛声，黑衣组织成员听到警笛声，开始有些慌乱。
“不好，警察来了。我们先撤！”白大褂男人见状，无奈地下达了撤退命令。黑衣组织成员们纷纷丢下武器，四散而逃。
警方很快赶到了现场，对受伤的黑衣组织成员进行了抓捕。柯南等人也终于松了一口气。
“这次虽然暂时击退了黑衣组织，但他们肯定还会再来。我们必须尽快找到应对之策，保护好‘命运之瞳’。”柯南说道。
众人回到神社内的密室，看着石棺中的“命运之瞳”，心中明白，这将是他们与黑衣组织接下来斗争的关键。他们该如何守护“命运之瞳”，又该如何找到青叶巫女所说的拥有纯净心灵和坚定意志之人？而黑衣组织又会采取怎样更加疯狂的手段来抢夺“命运之瞳”？柯南和他的伙伴们面临着前所未有的严峻挑战，未来的道路充满了未知和危险，但他们已经做好了准备，为了守护世界的和平与安宁，将与黑衣组织展开一场惊心动魄的最终对决......