星轨世界的悬浮岛屿上，重建的钟声悠扬回荡，工匠们操纵着光元素修复破损的建筑，孩子们的欢笑声重新洒满街道。小满站在学院的了望塔上，星轨权杖斜倚身旁，机械表残片在阳光下泛着温润的光。她望着远处新落成的孤儿院，白薇的项链坠子被镶嵌在塔顶，如同一颗永不熄灭的星。
然而，平静的表象下，暗潮悄然涌动。现实世界的新闻频道不断播报离奇事件：北极圈出现永不消散的暗物质极光，吞噬了所有靠近的科考队；热带雨林深处，树木扭曲成诡异的星轨纹路，凡是踏入者皆失去踪迹；就连星轨世界，也开始出现星轨偏移现象，悬浮岛屿的运行轨道变得极不稳定。
“这些事件的能量波动，都与渊魇残留的气息吻合。” 白薇的医疗记录板在顾言手中微微发烫，上面的数据曲线疯狂跳动，“更诡异的是，所有异常点都在形成某种隐秘的阵列。” 他将怀表碎片投影在空中，那些原本代表封印石残片的光点，此刻竟开始连成神秘的图案。
苏璃的古籍在深夜自动翻开，空白页上渗出黑色墨迹，拼凑成一行血字：“影渊余烬，借体还魂，七窍生门，终焉再临。” 她猛地坐起身，紫色项链碎片在月光下闪烁不安，“七窍生门... 难道是指现实世界与星轨世界的七个关键节点？” 暗影咒文不受控制地在她指尖游走，在地面勾勒出残缺的阵图。
萧诺的灵魂形态在冥想中突然剧烈震颤，邪神残留意识的黑雾再次涌现，却不再是充满恶意的侵蚀。他看到了一段模糊的记忆：在远古时期，曾有七位强大的守护者，用自己的生命在两界建立了七个 “平衡枢纽”，而如今这些枢纽正在被某种力量腐蚀。“那些异常点... 是平衡枢纽在发出求救信号！” 他惊出一身冷汗，风元素将他瞬间传送到学院大厅。
小满召集伙伴们时，发现孤儿院的孩子们出现了新的症状。他们在睡梦中会无意识地画出暗物质符文，白薇留下的治愈设备显示，孩子们体内的暗物质残留正在以一种诡异的频率共鸣。“这不是自然的异变，” 小满握紧拳头，“有人在刻意引导，想要利用孩子们作为容器！”
众人决定兵分三路。顾言带领战士们前往北极圈，混沌战刀在他手中嗡嗡作响，刀刃上跳动的火焰与暗物质极光产生剧烈反应；苏璃带着暗影小队深入热带雨林，暗影咒文化作藤蔓，在扭曲的树木间开辟道路，古籍上的血字随着他们的深入变得愈发鲜红；小满、萧诺和部分学者留守星轨世界，研究星轨偏移现象，试图找到稳定两界平衡的方法。
顾言的队伍刚踏入北极圈，就被一股刺骨的寒意笼罩。暗物质极光中，隐约浮现出无数人脸，他们的表情凝固在恐惧与绝望中。“这些都是被吞噬的科考队成员...” 顾言的声音低沉，混沌战刀劈开极光，却发现被斩断的部分瞬间重组。他的怀表碎片突然发出尖锐的蜂鸣，在地面投射出一个巨大的冰雕 —— 那是一个被暗物质包裹的人形，胸口处镶嵌着一块散发幽光的石头。
苏璃在热带雨林中遭遇了更诡异的敌人。那些由树木扭曲而成的怪物，不仅能吸收暗影咒文的力量，还会模仿她的攻击方式。她的队员们接连受伤，古籍上的血字突然化作实体，在空中组成一个巨大的警告符号。“小心！这些怪物是用来拖延时间的！” 她大喊着，暗影力量在周身凝聚成护盾，却发现护盾表面开始出现细小的裂痕。
星轨世界这边，小满通过星轨权杖连接上所有悬浮岛屿的监测系统，发现所有岛屿的运行轨道都在向一个神秘坐标偏移。机械表残片与这个坐标产生强烈共鸣，她的脑海中闪过母亲的记忆片段：在星轨大战时，十二星宫神明曾用一座 “星轨天秤” 维持世界平衡，而现在，这座天秤正在失去重心。
萧诺在研究孩子们的暗物质共鸣时，意外发现他们画出的符文组合在一起，竟是打开某个古老遗迹的钥匙。遗迹的位置，恰好位于星轨世界与现实世界的交界处。“这个遗迹... 或许藏着对抗渊魇残余力量的关键。” 他的风元素在实验室里卷起风暴，将所有研究资料吹向小满，“我们必须立刻出发！”
当小满等人准备前往遗迹时，星轨学院突然遭到不明势力的袭击。无数暗物质乌鸦从天空中俯冲而下，它们的眼睛里闪烁着渊魇的紫光，每一只乌鸦的嘴里都叼着一张纸条，上面写着：“守护者们，游戏才刚刚开始。” 在乌鸦群的掩护下，一个神秘人潜入了存放封印石的密室，而此时的封印石，正发出不安的震颤。