一场更加残酷的战争，即将在凡界与神域之间展开。地下的火种已经点燃，反抗的浪潮正在酝酿。阿斯加德的神使们凭借着强大的神能，试图用暴力镇压一切抵抗；而秃头鹰的超级英雄，则在黑暗中寻找着希望的光芒。这场战争，不仅关乎秃头鹰国的存亡，更关乎世俗世界科技文明的未来，是彻底沦为神权的奴隶，还是在抗争中获得真正的自由。
托尼·斯塔克正在研发更强大的反神权武器，他的实验室里，一台搭载了凤凰之力核心的巨型机甲正在组装；琴·葛蕾和旺达在训练更多的异能者，帮助他们掌控自己的力量；史蒂夫·罗杰斯则在制定新的游击战术，准备对阿斯加德的信仰采集装置发起新一轮的攻击。
泽诺族和晶体族的科学家们正在合作研发“神纹干扰卫星”，一旦发射成功，就能在全球范围内干扰阿斯加德的神纹能量；瓦坎达的特查拉国王已经联系了非洲的多个国家，组建了一支由振金机甲和异能者组成的联军，准备从南方进攻阿斯加德的统治区。
哈兰的清剿计划虽然残酷，但并没有打垮地下抵抗组织的意志。相反，越来越多的不满神殿霸道做法的人类加入了抵抗的行列，无数的情报汇聚而来，工程师帮助修复武器和装备，医生救治受伤的战士。在神殿那一纸要求民众都信奉奥丁众神的指令下，秃头鹰国内那些信奉各种神明的民众团结达到了前所未有的高度，一场信仰的战争就要拉开帷幕。
在纽约的一条地下通道里，一名年轻的沙漠地区的女孩正在给抵抗者传递情报。她的父母因为从出生就信奉的信仰问题而被杀害，她从一个富裕无忧的金领阶层的子弟变成了一名孤苦伶仃的孤儿。她手中的情报，标注着神殿各个信仰采集装置的所在位置，那是奥丁神殿真正的命脉所在，只要摧毁这些，阿斯加德的神侍军团就会因为出师不利的罪责被神明惩罚，信仰之力是三大神殿要抢夺的关键资源。
史蒂夫·罗杰斯拿到情报后，立即召开了核心会议。“这是我们的机会。”史蒂夫指着地图上的位置，“位于纽约的中央车站地下的采集点，情报显示这里由克雷克的潮汐部队守护，防御极其严密。但只要我们能摧毁它，就能打击奥丁神殿的军心，甚至于那些神使也要受到前所未有的惩罚，我们已经从外域盟友处得知，信仰力是那些贪婪的神明恢复力量的关键，还是他们这些神使晋升新神后，凝练神格的关键。如果让他们这样一直收集下去，以后我们更没有战胜他们的机会了。”
“我愿意带领突击小队前往。”托尼·斯塔克说道，他的新机甲已经完成，机甲的胸口镶嵌着一枚凤凰之力核心，“这台‘凤凰战甲’能承受神使的全力一击，而且能释放出与琴同源的凤凰火焰，足以摧毁中转仓库的神纹护盾。”
“我和你一起去。”琴·葛蕾说道，“我的凤凰之力能为你的战甲提供能量，而且能牵制住克雷克的潮汐之力。”
“剩下的人，负责发动‘全面起义’。”史蒂夫看着众人，“在托尼和琴攻击储备库的同时，所有地下抵抗组织一起行动，攻击阿斯加德的统治机构和各个采集点，吸引他们的注意力。科拉尔的星巢空间站和瓦坎达的联军也会同时发起攻击，让阿斯加德首尾不能相顾。”
行动时间定在一周后的月圆之夜。那一天，阿斯加德的神侍会举行“月神祭祀”，大部分神使都会参加，储备库的防御会相对薄弱。
月圆之夜，纽约的上空挂着一轮皎洁的明月。阿斯加德的神侍们在中央公园举行祭祀仪式，哈兰站在祭坛上，正在诵读神谕。突然，城市的各个角落同时爆发了起义，抵抗者们用自制的武器攻击神侍的巡逻队，超级英雄们带领小队突袭阿斯加德的据点，瓦坎达的振金机甲从南方攻入纽约，泽诺人的战机编队在天空中与英灵战车缠斗。
哈兰看着城市中燃起的战火，脸色大变：“该死的地老鼠，他们的情报工作做的很到位，知道今天是我们祭祀月神的日子，他们的目标一定是储备库！克雷克，立即带领潮汐部队返回储备库！”
但已经晚了。托尼·斯塔克的凤凰战甲和琴·葛蕾已经潜入了中央车站的地下储备库。储备库的神纹护盾由数十名神侍共同维持，托尼的战甲释放出凤凰火焰，与护盾碰撞在一起。护盾剧烈波动起来，神侍们的脸色变得苍白，神能消耗速度远超预期。
“琴，该你了！”托尼大喊一声，胸口的凤凰核心爆发出刺眼的光芒。琴的凤凰虚影与战甲的火焰融合在一起，形成一道巨大的金色火焰柱，朝着护盾冲去。护盾瞬间破碎，神侍们被火焰柱击中，化为金色光屑。
储备库的大门被打开，里面堆放着无数枚封存着信仰之力的神能水晶，散发着浓郁的能量波动。托尼正要启动战甲的“过载模式”，准备用凤凰火焰凝聚成一枚巨大的能量球，将眼前这些神殿势力视为珍宝的信仰之力销毁。
就在这关键时候，克雷克带领潮汐部队赶到了。他骑着海蛇，手中的三叉戟释放出巨大的海浪，朝着托尼和琴冲去。“该死的渎神者，休想破坏储备库！”
琴立即转身，凤凰之力形成一道屏障，挡住了海浪。“托尼，快去摧毁水晶！我来挡住他！”
托尼也没有半点犹豫，一颗无比巨大能量球形成后，猛的朝着神能水晶砸去。水晶中的能量瞬间被点燃，也是信仰之力特殊，必须用神能水晶才能封存，引发了连锁反应，巨大的爆炸从地下传来，整个中央车站都被炸毁，地面炸开了一个巨大的洞穴，神能水晶的碎片飞上天空后，如同金色的雨点般落在了地上。