引据古今经史百家书目
李时珍说：自陶弘景、唐代、宋代以来所引用的，共有一百五十一家。我所引用的，除旧本之外，共有四百四十家。
《周易注疏》
作者：魏·王弼、晋·韩康伯注，唐·孔颖达疏
《本草纲目》引用：散见各卷（如卷一“序例”引《易》论阴阳）。
《毛诗注疏》
作者：汉·毛亨（毛苌传）、唐·孔颖达疏
《本草纲目》引用：多引动植物名（如卷十五“艾”引《诗》注）。
《尔雅注疏》
作者：晋·郭璞注，宋·邢昺疏（李巡为东汉注家，已佚）
《本草纲目》引用：卷十四“薄荷”引《尔雅》释草名。
《尚书注疏》
作者：旧题汉·孔安国传（实为伪托），唐·孔颖达疏
《本草纲目》引用：卷三十七“茯苓”引《尚书·禹贡》。
《春秋左传注疏》
作者：晋·杜预注，唐·孔颖达疏
《本草纲目》引用：卷二十六“姜”引《左传》典故。
《孔子家语》
作者：旧题三国·王肃注（托名孔子）
《本草纲目》引用：卷三十九“蜂蜜”引《家语》论养生。
《礼记注疏》
作者：汉·郑玄注，唐·孔颖达疏
《本草纲目》引用：卷二十五“酒”引《礼记》制酒法。
《周礼注疏》
作者：汉·郑玄注，唐·贾公彦疏
《本草纲目》引用：卷十五“芍药”引《周礼》药用记载。
《列子注》
作者：东晋·张湛注（原书托名列御寇）
《本草纲目》引用：卷五十二“人部”引《列子》论养生。
《庄子注》
作者：晋·郭象注（原书庄周）
《本草纲目》引用：卷三十七“柏实”引《庄子》寓言。
《荀子注》
作者：唐·杨倞注（原书荀况）
《本草纲目》引用：卷六“水部”引《荀子》论自然。
《淮南鸿烈解》
作者：汉·刘安编，高诱注
《本草纲目》引用：卷七“丹砂”引《淮南子》炼丹说。
《吕氏春秋》
作者：秦·吕不韦编，汉·高诱注
《本草纲目》引用：卷二十三“麦”引《吕览》农时记载。
《抱朴子》
作者：晋·葛洪
《本草纲目》引用：卷九“金银”引《抱朴子》炼丹术。
《战国策》
作者：汉·刘向编订
《本草纲目》引用：卷三十八“弓弩”引策中典故。
《史记》
作者：汉·司马迁
《本草纲目》引用：卷四十八“鸡”引《史记·货殖列传》。
《汉书》
作者：汉·班固
《本草纲目》引用：卷十五“薏苡”引《汉书·马援传》。
《后汉书》
作者：南朝宋·范晔
《本草纲目》引用：卷五十“牛”引《后汉书》民俗。
《三国志》
作者：晋·陈寿
《本草纲目》引用：卷三十六“枸杞”引《三国志·吴书》。
《晋书》
作者：唐·房玄龄等（王隐《晋书》为私修，已佚）
《本草纲目》引用：卷四十七“鹤”引《晋书》轶事。
《宋书》
作者：南朝梁·沈约
《本草纲目》引用：卷三十七“五加皮”引《宋书》药效。
《梁史》
作者：疑为唐·姚思廉《梁书》（萧显明无考）
《本草纲目》引用：未明确标注。
《北史》
作者：唐·李延寿
《本草纲目》引用：卷三十四“胡椒”引《北史》西域传。
《隋书》
作者：唐·魏征等
《本草纲目》引用：卷十四“迷迭香”引《隋书》贡品。
《唐书》
作者：宋·欧阳修等《新唐书》
《本草纲目》引用：卷二十六“蒜”引《唐书》食疗方。
《轩辕本纪》
作者：唐·王瓘（托名黄帝）
《本草纲目》引用：卷一“序例”引黄帝制药传说。
《穆天子传》
作者：晋·郭璞注（原书作者不详，传为战国时人）
《本草纲目》引用：未查得明确引用。
《秦穆公传》
作者：不详（疑为后世伪托）
《本草纲目》引用：未查得明确引用。
《蜀王本纪》
作者：汉·扬雄
《本草纲目》引用：未查得明确引用。
《鲁定公传》
作者：不详
《本草纲目》引用：未查得明确引用。
《汉武故事》
作者：旧题汉·班固（一说南朝王俭）
《本草纲目》引用：卷五十一“鼠”部引汉武帝射鼠事。
《汉武内传》
作者：旧题汉·班固（实为六朝人伪托）
《本草纲目》引用：卷九“芝”类引西王母赐武帝灵芝事。
《壶居士传》
作者：不详（疑为道教典籍）
《本草纲目》引用：未查得明确引用。
《崔魏公传》
作者：不详（或为唐人所撰）
《本草纲目》引用：未查得明确引用。
《李宝臣传》
作者：不详（或为唐代人物传记）
《本草纲目》引用：未查得明确引用。
《何君谟传》
作者：不详
《本草纲目》引用：未查得明确引用。
《李孝伯传》
作者：不详（或为北朝人物传记）
《本草纲目》引用：未查得明确引用。
《李司封传》
作者：不详
《本草纲目》引用：未查得明确引用。
《柳宗元传》
作者：唐·韩愈等（或后世所撰）
《本草纲目》引用：未查得明确引用。
《梁四公子记》
作者：唐·张说（一说沈约）
《本草纲目》引用：卷四十六“龙”部引梁武帝时四公子辨龙涎事。
《唐武后别传》
作者：不详（或为唐代野史）
《本草纲目》引用：未查得明确引用。
《南岳魏夫人传》
作者：唐·颜真卿（或道教典籍）
《本草纲目》引用：未查得明确引用。
《三茅真君传》
作者：南朝·陶弘景（或道教后人）
《本草纲目》引用：未查得明确引用。
《神仙传》
作者：晋·葛洪
《本草纲目》引用：散见多卷（如卷十二“人参”引仙人服食法）。
《搜神记》
作者：晋·干宝
《本草纲目》引用：卷四十三“蛇”部引李寄斩蛇事。
《紫灵元君传》
作者：不详（道教典籍）
《本草纲目》引用：未查得明确引用。
《列仙传》
作者：汉·刘向
《本草纲目》引用：卷十四“莎草”引仙人服食方。
《稽神录》
作者：宋·徐铉
《本草纲目》引用：卷四十二“蜈蚣”引怪异记载。
《玄中记》
作者：晋·郭璞
《本草纲目》引用：卷五十一“狐”部引狐妖化人事。
《洞微志》
作者：宋·钱易
《本草纲目》引用：未查得明确引用。
《洞冥记》
作者：汉·郭宪
《本草纲目》引用：卷八“玉”部引汉武帝获神芝事。
《广异记》
作者：唐·戴孚（一说乐史）
《本草纲目》引用：未查得明确引用。
《异苑》
作者：南朝宋·刘敬叔
《本草纲目》引用：卷四十八“鸡”部引妖异故事。
《拾遗记》
作者：晋·王嘉（字子年）
《本草纲目》引用：卷十一“石芝”引仙人采药传说。
《续齐谐记》
作者：南朝梁·吴均
《本草纲目》引用：卷三十九虫部·蜂蜜引其载徐仙姑用蜜治目疾事。
《酉阳杂俎·异术》
作者：唐·段成式
《本草纲目》引用：卷二十六菜部·芥引其载西域僧咒术事。
《典术》
作者：三国魏·王建平
《本草纲目》引用：卷九石部·云母云母乃五行之精说。
《通典·异类》
作者：唐·杜佑
《本草纲目》引用：卷四十三鳞部·蛇类引西南夷用蛇胆疗疾记载。
《纂文》
作者：南朝宋·何承天
《本草纲目》引用：卷三十八服器部·梳篦引其释字。
《博物志》
作者：西晋·张华
《本草纲目》引用：卷四十六介部·牡蛎东海妇人化牡蛎传说。
《魏略》
作者：三国魏·鱼豢
《本草纲目》引用：卷十五草部·红蓝花引大秦国红花染色记载。
《神异经》
作者：旧题汉·东方朔（实为六朝伪托）
《本草纲目》引用：卷三十一果部·椰子东方朔识椰树故事。
《荆州记》
作者：南朝宋·盛弘之
《本草纲目》引用：卷三十七木部·荆木引宜都山荆树特徵。
《山海经》郭璞注
作者：晋·郭璞
《本草纲目》引用：卷五十一兽部·犀引注文释形态。
《九州记》
作者：三国魏·何晏
《本草纲目》引用：卷十四草部·藿香引交州藿香产地记载。
《荆楚岁时记》
作者：南朝梁·宗懔
《本草纲目》引用：卷二十五谷部·酒引端午饮菖蒲酒习俗。
《华山记》
作者：不详（或为晋·郭缘生）
《本草纲目》引用：卷十二草部·人参引华山参圃传说。
《广州记》
作者：晋·顾微\/裴渊（两部同名）
《本草纲目》引用：卷三十四木部·沉香引裴渊载蜜香树。
《南州记》
作者：唐·徐表
《本草纲目》引用：卷三十二果部·槟榔引岭南食槟榔法。
《嵩山记》
作者：不详（或为五代·卢鸿）
《本草纲目》引用：卷二十一草部·菖蒲引石上菖蒲记载。
《南州异物志》
作者：三国吴·万震
《本草纲目》引用：卷三十一果部·龙眼引南海龙眼特性。
《南蛮记》
作者：唐·房千里
《本草纲目》引用：卷三十九虫部·蜜引岭南崖蜜采集法。
《异物志》
作者：东汉·杨孚
《本草纲目》引用：卷四十三鳞部·鲮鲤鲮鲤吐舌诱蚁说。
《南方异物志》
作者：唐·房千里
《本草纲目》引用：卷四十七禽部·孔雀引交趾孔雀习性。
《太原地志》
作者：唐·李璋（一说李吉甫）
《本草纲目》引用：散见各卷（如卷九“石部·石灰”引述太原矿石）。
《岭表录异》
作者：唐·刘恂
《本草纲目》引用：卷四十三“鳞部·鲮鲤”等，记岭南异物。
《岭南异物志》
作者：唐·孟琯
《本草纲目》引用：卷三十一“果部·橄榄”引其载南方草木。
《永嘉记》
作者：南朝郑缉之
《本草纲目》引用：卷十四“草部·藿香”引永嘉地志。
《扶南记》
作者：三国吴·朱应
《本草纲目》引用：卷三十四“木部·沉香”引扶南国物产。
《燕吴行纪》
作者：唐·张氏（佚名）
《本草纲目》引用：卷十六“草部·蓼”引燕吴风俗。
《南城志》
作者：不详（疑为宋元方志）
《本草纲目》引用：散见地志资料（如卷二十七“菜部·蕨”）。
《五溪记》
作者：不详（唐以前地理书）
《本草纲目》引用：卷三十九“虫部·蜂”引五溪蛮地习俗。
《番禺记》
作者：唐·王德琏（一说王氏佚名）
《本草纲目》引用：卷三十四“木部·槟榔”引番禺物产。
《白泽图》
作者：传为黄帝时神兽白泽所述（六朝佚名辑）
《本草纲目》引用：卷五十“兽部·犀”引精怪辨识。
《宝藏论》
作者：五代·轩辕述
《本草纲目》引用：卷八“金石部·金”论矿物药性。
《丹台录》
作者：唐·青霞子（苏元朗）
《本草纲目》引用：卷九“石部·丹砂”引炼丹术。
《斗门经》
作者：不详（唐以前农书）
《本草纲目》引用：卷二十二“谷部·稻”引水利耕作。
《丹房镜源》
作者：唐·独孤滔
《本草纲目》引用：卷十一“金石部·盐”论炼丹原料。
《东华真人煮石法》
作者：托名东华真人（道教佚名）
《本草纲目》引用：卷十“石部·矾石”引方士秘法。
《房室图》
作者：不详（疑为道家养生书）
《本草纲目》引用：卷五十二“人部·人尿”引房中术。
《太清草木记》
作者：晋·葛洪（托名太清）
《本草纲目》引用：卷十二“草部·人参”引仙家药录。
《神仙芝草经》
作者：南朝梁·陶弘景（或托名）
《本草纲目》引用：卷二十八“菜部·芝”论灵草功效。
《异鱼图》
作者：唐·佚名
《本草纲目》引用：卷四十四“鳞部·乌贼”引绘图志。
《太清石璧记》
作者：唐·楚泽先生
《本草纲目》引用：卷九“石部·云母”引炼丹记录。
《灵芝瑞草经》
作者：不详（六朝道教书）
《本草纲目》引用：卷二十一“草部·菖蒲”引祥瑞说。
《粉图》
作者：晋·狐刚子（炼丹家）
《本草纲目》引用：卷八“金石部·粉锡”引制粉术。
《魏王花木志》
作者：北魏·魏收（或托名曹魏）
《本草纲目》引用：卷十四“草部·芍药”引园艺记载。
《夏禹神仙经》
作者：托名夏禹（汉晋方士）
《本草纲目》引用：卷六“水部·雨水”引巫医古法。
《四时纂要》
作者：唐·韩鄂
《本草纲目》引用：卷二十四“谷部·大豆”引农时种植。
《齐民要术》
作者：北魏·贾思勰
《本草纲目》引用：卷二十六“菜部·蒜”等广泛引农书技法。
《三洞要录》
作者：待考（道教典籍，或为南北朝至唐代道士所撰）
《本草纲目》引用：未明确提及（可能散见道教相关药物记载）。
《广志》
作者：晋·郭义恭
《本草纲目》引用：散见各卷（如卷三十“果部·荔枝”引其记岭南物产）。
《种植书》
作者：汉·汜胜之
《本草纲目》引用：卷二十二“谷部·黍”引其耕作之法。
《八帝圣化经》
作者：佚名（道教经典，或为六朝时期）
《本草纲目》引用：未明确对应章节。
《古今注》
作者：晋·崔豹
《本草纲目》引用：卷十五“草部·车前”引其释名。
《天香传》
作者：宋·丁谓
《本草纲目》引用：卷三十四“木部·沉香”引其论香品。
《八帝玄变经》
作者：佚名（道教典籍）
《本草纲目》引用：未明确对应章节。
《诗义疏》
作者：三国吴·陆玑（或作“陆机”）
《本草纲目》引用：卷十四“草部·芍药”引其释《诗经》植物。
《茶经》
作者：唐·陆羽
《本草纲目》引用：卷三十二“果部·茗”引其论茶性。
《神仙感应篇》
作者：佚名（道教文献）
《本草纲目》引用：未明确对应章节。
《该闻录》
作者：宋·李畋
《本草纲目》引用：卷十七“草部·曼陀罗花”引其记麻醉方。
《朝野佥载》
作者：唐·张鷟
《本草纲目》引用：卷四十六“介部·牡蛎”引其记民间验方。
《神仙秘旨》
作者：佚名（道教典籍）
《本草纲目》引用：未明确对应章节。
《谈苑》
作者：宋·杨亿
《本草纲目》引用：卷三十九“虫部·蜜蜂”引其记蜂房药用。
《开元天宝遗事》
作者：五代·王仁裕
《本草纲目》引用：卷十四“草部·牡丹”引其记宫廷花卉。
《修真秘旨》
作者：佚名（道教修炼典籍）
《本草纲目》引用：未明确对应章节。
《宣政录》
作者：待考（或为宋元时期政书）
《本草纲目》引用：未明确对应章节。
《明皇杂录》
作者：唐·郑处诲
《本草纲目》引用：卷十二“草部·人参”引其记玄宗时贡药。
《修真秘诀》
作者：颖阳子（道教人物，具体待考）
《本草纲目》引用：未明确对应章节。
《五行书》
作者：佚名（汉代谶纬类典籍）
《本草纲目》引用：卷七“土部·伏龙肝”引其五行理论。
《北梦琐言》
作者：宋·孙光宪
《本草纲目》引用：卷十五“草部·莎草”引其记民间传说。
《左慈秘诀》
作者：托名汉·左慈（实际或为六朝道士伪作）
《本草纲目》引用：卷九“石部·丹砂”引其炼丹术。
《广五行记》
作者：唐·吕才（一说佚名）
《本草纲目》引用：散见各卷（如卷十五“艾”条引其论灾异与药物关系）
《归田录》
作者：宋·欧阳修
《本草纲目》引用：卷十四“薄荷”条引其载薄荷疗疾事
《登真隐诀》
作者：梁·陶弘景（号隐居）
《本草纲目》引用：卷十二“人参”条引其论服食法
《遁甲书》
作者：传为黄帝或汉·张良（实际成书年代存疑）
《本草纲目》引用：卷九“丹砂”条引其论方位与采药时令
《梦溪笔谈》
作者：宋·沈括
《本草纲目》引用：卷十一“朴消”条引其辨矿物形态
《耳珠先生诀》
作者：唐·郑还古（号耳珠先生）
《本草纲目》引用：卷三十四“柏实”条引其养生方
《龙鱼河图》
作者：汉代纬书（佚名）
《本草纲目》引用：卷五十“牛”条引其神话记载
《野人闲话》
作者：五代·景焕
《本草纲目》引用：卷四十六“蜗螺”条引其民间验方
《韩终采药诗》
作者：传为秦代方士韩终（真伪存疑）
《本草纲目》引用：卷十八“菖蒲”条引其诗句
《论衡》
作者：汉·王充
《本草纲目》引用：卷三十九“蜂蜜”条引其论物性
《茆亭客话》
作者：宋·黄休复
《本草纲目》引用：卷四十八“鸡”条引其食疗记载
《金光明经》
作者：北凉·昙无谶译（佛经）
《本草纲目》引用：卷二十六“蒜”条引其戒律内容
《颜氏家训》
作者：北齐·颜之推
《本草纲目》引用：卷三十六“枸杞”条引其养生训诫
《范子计然》
作者：传为春秋·范蠡（托名）
《本草纲目》引用：卷二十三“胡麻”条引其物价记录
《化书》
作者：五代·谭峭（旧题宋齐丘撰，实为谭作）
《本草纲目》引用：卷五十二“人部”引其形神转化论
《楚辞》李善注《文选》
作者：唐·李善（注《文选》中《楚辞》部分）
《本草纲目》引用：卷三十七“木兰”条引注文释草木
《张协赋》
作者：晋·张协（《文选》收录《七命》等赋）
《本草纲目》引用：卷十四“兰草”条引其赋文
《本事诗》
作者：唐·孟棨
《本草纲目》引用：卷二十五“酒”条引其诗事
《江淹集》
作者：南朝梁·江淹
《本草纲目》引用：卷十七“芍药”条引其诗句
《宋王微赞》
作者：南朝宋·王微
《本草纲目》引用：卷十五“菊”条引其赞文
《庾肩吾集》
作者：南朝梁·庾肩吾
《本草纲目》引用：卷三十六“栀子”条引其诗
《陈子昂集》
作者：唐·陈子昂
《本草纲目》引用：卷十六“萱草”条引其诗
《陆龟蒙诗》
作者：唐·陆龟蒙
《本草纲目》引用：卷三十三“茶”条引《茶具诗》
《劝医文》
作者：南朝梁·简文帝萧纲
《本草纲目》引用：卷一“序例”引其论医德
上面所列的一百五十一家，是旧本引用的内容。